密闭式循环冷却水在冷却工艺介质之后，水的温度上升，是通过换热器由冷却介质间接冷却的。冷却介质可以用空气，也可以采用多种多样的无机或有机冷却剂。但循环冷却水并不和这些冷却介质直接接触。在密闭系统中一次充水之后，系统唢有蒸发，不浓缩，不排污，水量基本保持不变。这是密闭式与敞开式循环冷却水系统的区别。两种系统中都存在腐蚀、沉积和微生物问题，但处理方法不完全相同，各自有其不同特点。
1.密闭式系统的水质以腐蚀倾向为主，结垢倾向不严重。这是由于水基本上不浓缩，循环后易结垢的钙离子不增加。随补充水带入系统的氧气在腐蚀过程中虽有消耗，但变化不充分，系统中仍存在溶解氧。此外，密闭系统的冷泵及膨胀器等部位可能会有氧漏入系统。溶解氧会对系统产生氧腐蚀。还有些密闭系统采用软化水或除盐水，更易腐蚀。因此，系统中应加入以缓蚀为主的水处理剂。
2.一次性充水及一次性投加缓蚀阻垢剂。这是由于系统不排污、不蒸发，水和药剂基本不损失。虽然从设计意图上是完全密闭，但实际上系统中总是存在不同程度的泄漏损失。因此，还是需要定期或不定期向系统中补充水及水处理剂。
3.密闭系统中通常存在非常小的孔和冷却通道，常有低流速部位，并有较多的管道死角，容易发生局部沉积和腐蚀问题。
4.在一个系统中存在多种金属介质，可能发生电偶腐蚀。
5.密闭系统有各种类型，其操作温度各不相同，从0度以下到116度的高温都有。操作温度不同的系统需要不同方案。
6.严重的微生物问题。这是由于密闭系统水温合适，水停留时间长，有时工艺介质也漏入循环水中。常见微生物滋生繁殖，造成严重的粘泥问题。而使用非氧化性杀菌剂又会使费用增高。